一、短期停机在完成一天工作以后，都要停机等第二天再继续工作，则可按以下步骤停机。关闭二次仪表（记录仪、积分仪或色谱工作站）；关闭检测器电源（同时切断柱箱温度检测器的电源）；停止恒流泵工作，然后切断其电源；用二次蒸馏水冲洗进样阀的进样孔（在“LOAD” 和“INJECT”两个位置）；切断实验室工作电源，加满盛液瓶中的流动相，待第二天使用；将仪器罩上防尘罩。二、长期停机：仪器须数周或数月暂不使用，这时除按《短期停机》的以上步骤处理外，还须完成以下步骤：拆下恒流泵的流动相盛液瓶，换上色谱柱指定的保护试剂（例：甲醇、去离子水等），开启泵数分钟 （流速0.5 mL/min ~ 1.5 mL/min）后停泵；从系统中拆下色谱柱，用专用的密封螺帽将柱管两端密封后保存；用普通φ1.6导管替代分离柱联结；用二次蒸馏水或去离子水输入输液泵，开启泵，流量1mL/min~2mL/min， 冲洗泵体、进样阀、检测器流通池数分钟，在冲洗过程切换六通阀数次，使定量管得到清洗；拆除替代柱的导管、泵输入端和出口的导管和流通池输入、输出口导管， 分别用螺帽密封输液泵出口和流通池输入、输出口；拨下总电源接线板的插头，贮存好专用的流动相和样品，用干布擦洗仪器，罩上防尘罩；检测器存放地点应干燥。
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