任何颗粒物进入高效液相色谱仪仪后都会在柱子入口端被筛板挡住，最后的结果是将柱子堵塞，表现出的特征是仪压力增加并使色谱峰变形。因此，要采取各种预防措施，包括操作步骤和商品仪器自身的各种过滤设计，努力防止或减少颗粒物进入高效液相色谱仪仪中，从而延长仪器和色谱柱的使用寿命，并提高数据的可靠性。在高效液相色谱仪仪中，颗粒物的主要来源有三个途径：流动相、被测样品和仪器仪部件的磨损物。高效液相色谱仪中三个途径颗粒物的过滤方法之流动相
如果流动相均由高效液相色谱级溶剂组成，流动相没有必要过滤。这是因为高效液相色谱级的有机溶剂，例如乙腈、甲醇等，然而，如果有任何一种缓冲液中加入了固体物，例如，磷酸盐，流动相过滤将是必要的一个步骤。流动相通过0.45μm微孔滤膜过滤对于从流动相中除去所有颗粒物是一个有效方法。0.2μm微孔滤膜也可以用，但是它们就这个应用而言并不比0.45μm微孔滤膜更有效，而且它的过滤速度会更慢，特别是当实验室使用的试剂和水的质量不太好时。
建议实验室在编写制定他们流动相制备标准操作程序（SOPs）时规定，可以借鉴国际上同类实验室的规定，即：流动相制备仅采用高效液相色谱仪级液体时不需要过滤，反之所有流动相组成在使用前必须过滤。在连接储液瓶和泵的输液管的末端入口采用下沉式过滤器也是很重要的。这个过滤器的规格为≥10μm的微孔物质，所以，它不能取代流动相过滤步骤，但是它能除去仪中的尘土并保证储液瓶、输液管使用的可靠性。
 
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