离子色谱仪技术是水质监测中的应用日趋成熟，成为水质监测中最为常见的一种应用技术。在选择应用离子色谱仪技术监测水质时，应注意离子色谱仪的使用，提升设备的使用寿命和使用效率。
(一)保持温度稳定
在开展水质水样监测时，若温度不稳定，上下波动时，会导致色谱柱压力发生波动变化，最终会导致离子色谱仪基线不稳、保留时间偏移，监测结果达不到预期的重复性。因此，需要在正式监测前要合理的控制好温度，并保持这种温度的稳定性，具体办法有:将分析监测的仪器设备放置在空调边或者窗口前，必要时安装相应的柱温箱，在水样取样后再放置片刻，以确保离子色谱仪柱温与样品温度一致时再选择进样。(二)水样过滤
在监测样品水样水质之前，应选择0.45μm滤膜对待测水样进行相应的抽滤，以防止水样中的细颗粒物在后期离子色谱仪使用时堵塞设备的管路，影响监测效果和设备使用寿命。
(三)水样稀释
利用离子色谱仪技术监测分析组分复杂水样的，待测水样中的离子对树脂亲和力有较大差距，这时需要将各种浓度的淋洗液进行反复进样。其中，阴离子的分析进样量最大柱容为30%。当待测水样水质浓度过高的，还需对待测水样水质进行进一步的稀释，避免出现因待测水样水质浓度含量过高而出现色谱峰拖尾且宽。
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